Bechtěrevova choroba se soustřeďuje na malé kloubky mezi jednotlivými obratli. Zánětlivý proces však postihuje i měkké tkáně podél páteře, které se postupně mění v jizevnatou tkáň a vápenatí. Proces se rozšiřuje a stěhuje na další úseky páteře a postupně omezuje její pohyb. Může dojít ke ztuhnutí celé páteře. MB se však nevyhýbá ani dalším kloubům, úponům vazů a šlach na vlastní kosti (mohutné svaly v oblasti pánve, ramenní pletence, úpony Achillovy šlachy..). Vyjímkou není ani zánět oční duhovky - iritida a další interní projevy.
